สาเหตุของความเค็มทุติยภูมิของดิน
① ระบบชลประทานไม่ตรงกัน การระบายน้ำไม่ราบรื่น เพียงชลประทานแต่ไม่ระบายน้ำ หรือการชลประทานหนักและการระบายน้ำเบา เพื่อให้น้ำชลประทานจำนวนมากเติมน้ำใต้ดิน
② การให้น้ำล้นเกินด้วยน้ำท่วม การชลประทานที่ไม่สามารถควบคุมได้ ส่งผลให้มีการชลประทานมากเกินไป และทำให้ระดับน้ำใต้ดินสูงขึ้น
③การรั่วไหลของช่องสัญญาณเป็นเรื่องร้ายแรง หลังจากการผันน้ำในระยะยาว ระดับน้ำใต้ดินทั้งสองด้านของช่องจะเพิ่มขึ้น
④การเก็บน้ำในอ่างเก็บน้ำไม่เหมาะสม ระดับน้ำในอ่างเก็บน้ำธรรมดาโดยทั่วไปจะสูงกว่าระดับพื้นดิน หากระบบปิดรอบอ่างเก็บน้ำทำงานไม่ถูกต้อง จะส่งผลให้ระดับน้ำใต้ดินรอบอ่างเก็บน้ำเพิ่มขึ้นอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้
⑤ นาข้าวและนาแห้งตั้งอยู่ติดกัน และไม่มีสิ่งกีดขวางการซึมผ่านรอบนาข้าว เพื่อให้ระดับน้ำใต้ดินในนาแห้งจะเพิ่มขึ้นและดินจะมีความเค็ม
นอกจากนี้ การทำนาที่กว้างขวาง การปลูกและการใส่ปุ๋ยที่ไม่สมเหตุผล เช่น การไม่ใส่ใจกับการปรับระดับดิน การเพิ่มปุ๋ยอินทรีย์และการปลูกอย่างทันท่วงที ก็อาจทำให้ดินกลับเป็นเกลือได้เช่นกัน