ในปี 2013 ไม่มีการจําแนกประเภทที่ชัดเจนของอาหารดัดแปลงพันธุกรรมและการจําแนกประเภทที่แตกต่างกันสามารถทําได้ตามมาตรฐานที่แตกต่างกันตามการปฏิบัติ
ตามที่ว่าอาหารดัดแปลงพันธุกรรมมีแหล่งดัดแปลงพันธุกรรมเป็นมาตรฐานหรือไม่มันสามารถแบ่งออกเป็นสามประเภทต่อไปนี้:
(1) อาหารดัดแปลงพันธุกรรมที่ไม่มีอาหารดัดแปลงพันธุกรรมหมายถึงอาหารที่ได้จากสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรม แต่ผลิตภัณฑ์เองไม่มียีนที่ถ่ายโอน
(2)อาหารดัดแปลงพันธุกรรมมีส่วนผสมดัดแปลงพันธุกรรม, แต่ลักษณะของพวกเขามีการเปลี่ยนแปลงในระหว่างการประมวลผล, และยีนที่ใช้งานที่ถ่ายโอนไม่มีอยู่ในอาหารดัดแปลงพันธุกรรม.
(3)อาหารดัดแปลงพันธุกรรมมีส่วนประกอบทางพันธุกรรมที่ใช้งานของ หลังจากที่ผู้คนกินสิ่งมีชีวิตหรืออาหารดัดแปลงพันธุกรรมยีนที่ถ่ายโอนและยีนโดยธรรมชาติของสิ่งมีชีวิตจะส่งผลต่อร่างกายมนุษย์
