คราบจุลินทรีย์ส่วนใหญ่เป็นอันตรายต่อฟันและเหงือกซึ่งเป็นสองโรคที่พบบ่อยที่สุดในช่องปาก ได้แก่ โรคฟันผุและโรคปริทันต์
โรคฟันผุเป็นที่รู้จักกันทั่วไปว่า" เวิร์ม" โดยที่" เวิร์ม" หมายถึงแบคทีเรียในคราบจุลินทรีย์ คราบฟันติดแน่นกับผิวฟัน แบคทีเรียกินน้ำตาลในน้ำลายและสลายน้ำตาลเพื่อผลิตกรด กรดเหล่านี้จะทำลายฟันและสร้างโพรงในที่สุด
เมื่อคราบฟันอยู่ใกล้กับเหงือกสารพิษและสารอันตรายอื่น ๆ ที่เกิดจากแบคทีเรียสามารถทำให้เหงือกระคายเคือง (เรียกทั่วไปว่า" เหงือก" และ" เหงือก") ทำให้เกิดการอักเสบกล่าวคือ เหงือกอักเสบ หากไม่ได้รับการควบคุมและปล่อยให้เกิดโรคเหงือกอักเสบอาจพัฒนาไปสู่โรคปริทันต์อักเสบที่ไม่สามารถกลับคืนสภาพเดิมได้ซึ่งก่อให้เกิดความเสียหายต่อกระดูกถุงและนำไปสู่การคลายตัวและการสูญเสียฟันในที่สุด