การหมักด้วยจุลินทรีย์หมายถึงกระบวนการของการใช้จุลินทรีย์เพื่อแปลงวัตถุดิบเป็นผลิตภัณฑ์ที่จำเป็นสำหรับมนุษย์ผ่านวิถีการเผาผลาญเฉพาะภายใต้สภาวะที่เหมาะสม ระดับของการผลิตการหมักของจุลินทรีย์ส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับลักษณะทางพันธุกรรมและสภาวะการเพาะเลี้ยงของสายพันธุ์เอง
