มีสี่วิธีสําหรับอนุภาคนาโนที่จะเข้าสู่ร่างกายมนุษย์: การสูดดมการกลืนการดูดซึมจากผิวหนังหรือการฉีดโดยเจตนา (หรือปล่อยออกจากรากฟันเทียม) ในระหว่างขั้นตอนทางการแพทย์ เมื่ออยู่ในร่างกายมนุษย์พวกเขามีความคล่องตัวในระดับสูง ในบางกรณี, พวกเขายังสามารถข้ามอุปสรรคเลือดสมอง.
พฤติกรรมของอนุภาคนาโนในอวัยวะยังคงเป็นเรื่องใหญ่ที่จะศึกษา โดยทั่วไปพฤติกรรมของอนุภาคนาโนขึ้นอยู่กับขนาดรูปร่างและกิจกรรมการมีปฏิสัมพันธ์กับเนื้อเยื่อโดยรอบ พวกเขาอาจทําให้เกิด "การโอเวอร์โหลด" ของ phages (เซลล์ที่กลืนและทําลายสารแปลกปลอม) ซึ่งสามารถทําให้เกิดไข้ป้องกันและลดภูมิคุ้มกันของร่างกาย พวกเขาอาจสะสมในอวัยวะเพราะพวกเขาไม่สามารถย่อยสลายหรือย่อยสลายช้า ความกังวลอื่นคืออันตรายที่อาจเกิดขึ้นจากปฏิกิริยาของพวกเขากับกระบวนการทางชีวภาพบางอย่างในร่างกายมนุษย์ เนื่องจากพื้นที่ผิวขนาดใหญ่อนุภาคนาโนที่สัมผัสกับเนื้อเยื่อและของเหลวจะดูดซับโมเลกุลขนาดใหญ่ที่พวกเขาพบทันที สิ่งนี้จะส่งผลต่อกลไกการปรับเอนไซม์และโปรตีนอื่น ๆ