การอาบน้ําร่างกายเป็นวิธีที่พบมากที่สุดในการอาบน้ําแร่ซึ่งช่วยให้ร่างกายมนุษย์สามารถสัมผัสกับน้ําแร่ได้อย่างเต็มที่จึงก่อให้เกิดผลกระทบทางชีวภาพที่สําคัญ ส่วนประกอบทางเคมีในน้ําแร่สามารถมีผลต่อร่างกายได้สองวิธี: การสัมผัสโดยตรงของน้ําแร่บนผิวหนัง
สารในน้ําแร่เข้าสู่ร่างกายผ่านผิวหนังและร่างกายจะกําจัดสารผ่านผิวหนังไปยังน้ําแร่ ตัวอย่างเช่นการอาบน้ําแร่ hypotonic สามารถละลายคลอไรด์คอเลสเตอรอลและน้ําตาลในผิวหนัง ในห้องอาบน้ําฤดูใบไม้ผลิที่เป็นกรดผิวหนังจะปล่อยโพแทสเซียมและแคลเซียมและในห้องอาบน้ําฤดูใบไม้ผลิอัลคาไลน์ผิวหนังจะปล่อยคลอรีน การประยุกต์ใช้การศึกษา radioisotope ยืนยันว่าไอออนบางอย่างในน้ําแร่สามารถเข้าสู่ร่างกายในระหว่างการอาบน้ําและปริมาณที่เข้าสู่ร่างกายเกี่ยวข้องกับอุณหภูมิฤดูใบไม้ผลิความเข้มข้นของไอออนในน้ําฤดูใบไม้ผลิและเวลาอาบน้ํา น้ําแร่ที่มีลักษณะทางกายภาพและทางเคมีที่แตกต่างกันมีผลกระทบที่แตกต่างกันในร่างกาย น้ําพุที่เป็นกรดมีผลต่อสมานแผลบนผิวหนัง น้ําพุอัลคาไลน์สามารถส่งเสริมการหลั่งเยื่อบุผิว; น้ําพุไนโตรเจนมีผลต่อการเพิ่มการทํางานของร่างกายคล้ายกับน้ําพุเรดอน; น้ําพุสารหนูสามารถลดน้ําตาลในเลือดและมีผลเป็นปฏิปักษ์เช่น thyroxine วิธีการอาบน้ํามีสองประเภท: แนวนอนและนั่ง ตําแหน่งกึ่งขี้เกียจใช้สําหรับอาบน้ําแนวนอน ผู้อาบน้ําควรนอนบนหลังของเขาและแช่ในอ่างอาบน้ําหรืออ่างอาบน้ําโดยมีหัวคอและหน้าอกสัมผัสกับผิวน้ําและผิวน้ําไม่ควรเกินระดับของหัวนม ท่านั่งคือใช้ท่านั่งแช่ในอ่างอาบน้ํา และมีเพียงหัวเท่านั้นที่จะสัมผัสกับผิวน้ําระหว่างอาบน้ํา การอาบน้ําในแนวนอนเป็นเรื่องง่ายสําหรับผู้ป่วยที่จะยอมรับภาระน้อยลงในอวัยวะหัวใจและปอดและอ่างนั่งส่วนใหญ่เหมาะสําหรับนักอาบน้ําที่มีร่างกายที่ดีขึ้น